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Annual Report 2016

  • Hardware

Actualización 2015

En Febrero 2015 se pone en producción la siguiente ampliación del sistema:

18 HP ProLiant XL230a Gen9 – Compute node (node configuration)
Processor

2 x Intel Haswell E5-2680

2.5 GHz, 30MB Level 3 Cache, 120W, 12 cores per processor

Memory

64 GB

Storage

2 x 1TB 6G SATA 7.2K 2.5in

Networking

Dual Port Intel 1GbE NIC

Dual Port Infiniband FDR 40Gb

Actualización 2014

En Junio 2014 se pone en producción la siguiente ampliación del sistema:

10 HP ProLiant DL320e Gen8 v2 – Compute node (node configuration)
Processor

1 x Intel Haswell E5-1240

3.4 GHz, 8MB Smart Cache, 80W, 4 cores per processor

Memory

32 GB

Storage

1 x 2TB 6G SATA 7.2K 3.5in

Networking

Dual Port Intel 1GbE NIC

Actualización 2012

En Octubre 2012 se pone en producción la siguiente ampliación del sistema:

8 HP ProLiant SL230s Gen8 – Compute node (node configuration)
Processor

2 x Intel Sandy Bridge E5-2670

2.6 GHz, 20MB Level 3 Cache, 115W, 8 cores per processor

Memory

64 GB

Storage

1 x 2TB 6G SAS 7.2K

Networking

Dual Port Intel 1GbE NIC

Dual Port Infiniband FDR 40Gb

2 HP DL 560 Gen8 - Fat node (node configuration)
Processor

4 x Intel Sandy Bridge E5-4620

2.2 GHz, 16MB Level 3 Cache, 95W, 8 cores per processor

Memory

512 GB PC3-1333R

Storage

6 x 1TB 3G SAS 6G 7.2K NHP

Networking

Four Port HP 1GbE NIC

Dual Port Infiniband FDR 40Gb

Actualización 2011

En Marzo 2011 se ha puesto en producción la siguiente ampliación del sistema:

46 HP ProLiant SL165z G7 – Compute node (node configuration)
Processor

2 x AMD Opteron™ Processor 6174

2.2 GHz, 12MB Level 3 Cache, 80W, 12 cores per processor

Memory

32 GB (27 nodes) & 64 GB (19 nodes)

Storage

1 x 500GB 3G SATA 7.2K NHP

Networking

2 Embedded Dual Port Intel 1GbE NICs (4 total NICs)

4 HP DL 385 G7 - Visualization node (node configuration)
Processor

2 x AMD Opteron™ Processor Model 6174

2.2 GHz, 12MB Level 3 Cache, 80W

Memory

64 GB PC3-1333R

Storage

1 x 2TB 3G SATA 7.2K NHP

Networking

2 Embedded Dual Port Intel 1GbE NICs (4 total NICs)

Vis. Card

ATI Firepro V7800

Total
Processor

1,200 cores 2.2GHz

Memory

2,400 GB

Storage

31 TB

Networking

NFS GbE & Dedicated MPI GbE

Performance

10,240 GFlops

Power
consumption

21KW

CPU hours

10 Million hours

Perf./KW

487GFlops/KW

  • Estado de los sistemas

En el siguiente enlace podrá consultar el estado del SVG estado de los sistemas.

  • Guía de uso
    • Acceso:

    Se accede al sistema a través de svg.cesga.es siguiendo las instrucciones que se detallan a continuación:

    1. Conectarse a svg.cesga.es de la forma habitual

    2. Lanzar una sesión interactiva: compute --arch [amd|sandy]
    (amd: nodos AMD Opteron; sandy: nodos Intel Sandy Bridge)

    3. Cargar los módulos necesarios de compiladores, aplicaciones, etc.


    NOTAS:

    module av muestra los módulos disponibles

    module help muestra una ayuda básica de como utilizar el módulo

    • Envío de trabajos al sistema de colas:

    El envio de trabajos se realiza del siguiente modo:

    Trabajos secuenciales:

    qsub -l arch=[amd|sandy|ivy|haswell|ibhas],num_proc=1,s_rt=1:00:00,s_vmem=2G,h_fsize=20G trabajo.sh

    Trabajos paralelos openmp:

    qsub -l arch=[amd|sandy|ivy|haswell|ibhas],num_proc=16,s_rt=1:00:00,s_vmem=2G,h_fsize=20G trabajo.sh

    Trabajos paralelos MPI:

    qsub -l arch=[amd|sandy|ivy|haswell|ibhas],num_proc=1,s_rt=1:00:00,s_vmem=2G,h_fsize=20G -pe mpi 16 test.sh

    Para más detalles consultar la guía de Intel MPI


    Los limites máximos son los siguientes:

    • Memoria: hasta 1TB
    • Numero de cores por nodo: hasta 32
    • Numero de cores por trabajo: hasta 192
    • Tamaño de scratch: hasta 4TB
    • Tiempo máximo de ejecución de trabajos: hasta 300 horas "elapsed" en nodos "amd" y hasta 48 horas en nodos "sandy"

    Puede obtener información detallada sobre la política de uso del SVG ejecutando:
    module help sge
    Esta política puede imponer restricciones adicionales sobre los límites máximos anteriores, pudiendo dinámicamente en función de las necesidades específicas en cada momento.

    • Sistemas de ficheros:

    Ver guía almacenamiento


    • Compiladores y herramientas de desarrollo: